九七式司令部偵察機の成功で、日本陸軍は戦略偵察機のさらなる性能向上を目指し、日中戦争の開始から５カ月後の１９３７（昭和１２）年１２月、三菱重工業に後継機として試作名称キ４６の開発を命じた。当然、要求仕様は九七式司令部偵察機を大きく上回るもので、最高速力が時速６００キロ超、航続力は時速４００キロの巡航速度で６時間以上とされた。三菱重工業では、設計に当たって機体の空力的洗練性を極限まで高めようと、流線形の胴体、空気抵抗を低減したエンジンナセルなどを作り上げ、エンジンには離昇出力８５０馬力の「ハ２６一」（海軍名称は『瑞星』）を採用した。試作１号機は３９（昭和１４）年末に完成したが、エンジンの出力不足から最高速力は要求仕様を下回る時速５４０キロにとどまった。 　陸軍は機体の完成度が高いことを認め、４０（昭和１５）年にキ４６を一〇〇式司令部偵察機一型として制式採用する一方、エンジン出力を向上させた改良型の開発を命じた。三菱重工業は、翌４１（昭和１６）年３月にエンジンを離昇出力１０８０馬力の「ハ１０２」（海軍名称は『瑞星二〇型』）に換装したキ４６二を初飛行させ、テストでは高度５８００メートルで時速６０４キロを記録、要求仕様をクリアした。キ４６二は４２（昭和１７）年６月に一〇〇式司令部偵察機二型として制式化され、ただちに実戦に投入された。写真は、一〇〇式司令部偵察機二型の性能をさらに向上させた三型